对于行程超出本州主干线的旅行者来说，国内航班不只是方便，而是必不可少。在一个连廉价航空都能像钟表一样准时运行的国家，乘飞机是体验日本地理多样性最有收获的方式之一。
日本航线网络
日本的国内航线网络十分广泛。两大主要航空公司是日本航空（JAL）和全日本空输（ANA），两者都是全服务航空公司。仅从羽田机场出发，全日空就飞往全国40多个机场。[1]主要枢纽包括东京羽田（HND）、东京成田（NRT）、大阪关西（KIX）、大阪伊丹（ITM）、名古屋中部（NGO）、福冈（FUK）和札幌新千岁（CTS）。
廉价航空也占据了相当份额。乐桃航空（Peach Aviation）和捷星日本（Jetstar Japan）在热门航线上提供简约的替代选择。请确认航班使用的机场和航站楼，因为廉价航班不一定与全服务航空公司使用同一机场。
东京与大阪之间的航线在空中竞争中处于劣势，因为最快的东海道新干线只需2小时21分钟即可从东京到达新大阪。飞机真正的优势在长途航线上：东京至札幌、东京至冲绳（那霸）、大阪至石垣岛，以及通往奄美和冲绳群岛小岛的航线。在那些地方，飞机往往是通往大陆唯一实用的交通方式。[2]
舱位与舒适度
日本国内航班相对较短，因此舱位结构比国际航线简单。日本航空和全日空在许多国内航线上都提供标准经济舱和高级舱。
日本航空和全日空的经济舱高于许多旅客的预期，座椅保养良好，腿部空间合理。高级舱座位更宽，服务也有所升级，在最繁忙的航线上深受商务旅客欢迎。在为升舱付费前，请先查看航空公司针对您所乘机型的座位图。
乐桃和捷星日本等廉价航空只提供单一舱位，额外服务另外收费，因此比较总费用时要把行李费算进去。乐桃允许总共2件物品，最多携带7 kg的随身行李；捷星日本航班同样包含7 kg的随身行李额度。[3][4]
预订与机票
日本航空推出JAL Japan Explorer Pass，这是一组国内航线特价票，可以让飞行的价格出人意料地亲民。它仅面向居住在日本境外、持有往返日本的国际机票的旅客，并可乘坐国内航线前往30多个城市。[5]购买前请在航空公司网站上查看最新条款。
直接在航空公司网站预订很简单，大多数网站都支持英文界面。若要比较多家航空公司的票价，找到适合您航线的最佳选择，可以使用GoAsia.cc等平台，在同一界面搜索日本国内航班及其他交通方式，方便您为行程中的每一段比较乘飞机还是坐火车。
提前购买通常价格最优，但低价票往往有改签和退票限制。全服务航空公司的现场购票价格一般较高，而廉价航空采用动态定价，因此尽早预订同样重要。
登机后的体验
日本国内航班以安静高效著称。登机井然有序，广播以日语和英语进行。
在日本航空和全日空，通常可以免费享用饮品。廉价航空则出售饮料和简单小吃。
Wi-Fi：全日空的国内航班Wi-Fi在大多数机型上对所有舱位免费提供，大约在起飞后5分钟开始。[6]廉价航空通常提供的机上服务较少，因此请在登机前下载所需内容。
行李处理效率很高，托运行李很快就会出现在行李转盘上。
日本航空旅行小贴士
- 尽量选择羽田而不是成田。东京羽田机场离市中心近得多，单轨列车和铁路接驳也很便利。预订前请确认您的航班使用东京的哪座机场。
- 提前到达。日本机场效率很高，但在黄金周、盂兰盆节和新年假期期间会非常拥挤，请预留充足时间。
- 与新干线比较。对于东京至大阪这样的中等距离，计入机场往返和安检时间后，新干线通常是门到门更快的选择。在更远的距离或岛屿目的地，飞机几乎总是更好的选择。
- 了解访日游客优惠票价。JAL Japan Explorer Pass就是一例。适用资格和预订条件都有限制，请仔细阅读细则。
- 坐廉价航班请轻装出行。乐桃和捷星日本对机内随身行李有重量限制，超重行李费很快就会累积。去机场前请先称一下行李。
- 留意台风季节。夏末和秋季的台风可能打乱航班时刻，尤其是前往冲绳和九州的航线。这些月份购买涵盖天气延误的旅行保险是明智之举。
- 探索显而易见之外的地方。国内航班能带你去许多游客忽略的目的地，例如鹿儿岛的火山景观、宫古岛的海滩、北海道东海岸的荒野，以及屋久岛的森林。
